La Planta de Tratamiento de Aguas Residuales "Agua Prieta" trata el 67% de las aguas residuales de la zona metropolitana de Guadalajara, equivalentes al servicio a 3,500,000 personas bajo un esquema de Construcción, Operación y Transferencia (BOT), que consiste en el diseño, construcción, financiación, operación y mantenimiento durante 20 años.

Los principales procesos son: pretratamiento, tratamiento primario, tratamiento biológico, tratamiento de lodos, digestión anaeróbica, deshidratación de lodos y cogeneración con biogás para la producción de energía eléctrica y recuperación de calor.